生物笔记5-组蛋白修饰
2023-03-26 本文已影响0人
江湾青年
组蛋白结构
在细胞核中，染色体是高度压缩的，而折叠时DNA缠绕的就是组蛋白。
细胞和中的染色质和DNA
将组蛋白区域放大，我们就会看到这样一串念珠，组蛋白被一根DNA序列串起来。
多个核小体
为了方便研究，我们将一个组蛋白和其附近 147bp DNA片段，叫一个核小体。也就是说，核小体 = 组蛋白 + DNA(147bp)
单个核小体png
把组蛋白拆开来，它其实有八个部分来构成：
组蛋白八聚体 = 2个H2B + 2个H2A + 2个H3 + 2个H4
单个核小体的组成
下面是检测到的组蛋白三维结构示意图，可以看到，每种组蛋白结构都会伸出来一小段“线头”，这是蛋白质的N端，也叫尾巴(tail)。
组蛋白三维结构
事实上，每个组蛋白结构都会延伸出这个“尾巴”，组蛋白修饰就是在这个尾巴上进行的。
组蛋白的N端修饰
组蛋白修饰的描述规则
这种修饰时一种以共价方式进行的蛋白质翻译后修饰（PTM），包括：甲基化（M），磷酸化（P），乙酰化（A）等等。
由于组蛋白修饰的类型众多，所以我们需要在称呼组蛋白修饰时，有一个规则：
组蛋白结构 + 氨基酸名称 + 氨基酸位置 + 修饰类型
例如：
H3K4me3：代表H3组蛋白的第4位赖氨酸的三甲基化
H3K14ac：代表H3组蛋白的第14位赖氨酸的乙酰化
组蛋白修饰的命名规则
这些修饰都会影响基因的转录活性。而组蛋白H3是修饰最多的组蛋白。
组蛋白修饰类型
甲基化（me）、乙酰化（ac）
不同组蛋白修饰的作用
这些组蛋白修饰也可以共同作用来完成调控，比如，H3K9ac也与H3K14ac和H3K4me3高度共存共同作为活性基因启动子的标志。
组蛋白修饰的检测
一般我们使用 ChIPseq 来对样本测序，以此来拿到全基因组上的组蛋白修饰图谱。
