CCLE查询基因在细胞系中表达

最近实在太忙了，好久没有更新我们的简书了，今天抽空无论如何也要更新。

示例：查询PDCD1在各个泛癌细胞系中表达情况。

首先我们打开我们的CCLE数据库上网页，网址走起，如果打开速度慢，请耐心等待https://portals.broadinstitute.org/ccle/

在检索栏中搜索我们要检索的基因，这里我们搜索“PDCD1”，点击“search”进行检索。

下图即是PDCD1在泛癌细胞系表达情况，我们可以点击右上侧的照相机按钮进行保存。但是这个表达量是个相对表达量，有时候出现CCLE和自己实验数据不吻合，这个时候还是要依据自己的实验数据，CCLE只是提供了一个参考。

点击页面下“Download  mRNA expression ”则可以下载表达谱。下载的表达谱是.txt，我们可以利用excel对该文档打开。如果想研究某肿瘤的细胞系该基因表达情况，你可以在表达谱搜索该肿瘤，会对应好几个细胞系，高亮一下，你所要研究的肿瘤细胞系就一目了然了。

总体来说，现在数据库千千万，是我们研究过程中辅助工具，我们可以借鉴它，但是它未必一定正确的，需要我们好好利用分析。