1.直接按照R未遂

一直以来想在服务器上安装R，可惜没有root权限，一直没有安装成功，期间我尝试过多种方法进行按照，比如独钓寒江的博客（http://blog.sina.com.cn/s/blog_6ac25ea00102whkc.html）的方法安装R，比之前的安装有所进步，但是最后卡在libcurl报错，一直没有解决，具体报错信息如下：

checking if libcurl supports https... no

configure: error: libcurl >= 7.22.0 library and headers are required with support for https

2.初识Anaconda

最开始接触Anaconda，还是在机器学习的时候用过，Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版，支持 Linux, Mac, Windows系统，提供了包管理与环境管理的功能，可以很方便地解决多版本python并存、切换以及各种第三方包安装问题。Anaconda利用工具/命令conda来进行package和environment的管理，并且已经包含了Python和相关的配套工具。

在机器学习过程中，使用Anaconda的确很方便，python包的安装、管理、Jupyter Notebook使用也特别方便灵活，可以使用大量粘贴复制命令，画图、运行也可以交互，便于直接查看画图结果，这对学习python图形展示是非常有用的方法。

Anaconda可以安装、管理R还是在无意中看到网上介绍（https://chrisconlan.com/installing-r-python-anaconda-biologists/），这篇文章较为详细的介绍了使用Anaconda安装python和R的方法。Anaconda安装不需要较高的权限，包的安装管理也较方便，正合我意。

3.Anaconda下载和安装

Anaconda可从官网下载所需要的版本；https://www.anaconda.com/download/

Anaconda安装：Anaconda安装较为简单，我下载的文件为：

Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh

sh Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh

交互界面根据提示选择，首先是否接受协议，选择yes

会显示安装路径选择，默认是在个人home目录下，也可以选择指定安装目录Prefix= /my/home/Anaconda3，需要注意的是，指定安装目录时/my/home/Anaconda3文件夹不能存在，/my/home/目录存在即可。安装最后会提示是否将Anaconda3添加到~/bashrc文件中，可以根据自己需要选择。

安装完成后，进入/my/home/Anaconda3/bin/，输入./conda，如果出现conda使用说明信息，说明安装成功。

4.Anaconda安装R

我这里没有将Anaconda添加到环境变量。

首先设置环境变量：export PATH=/my/home/Anaconda3/bin/:$PATH

安装R，首先需要配置conda：

conda config --add channels conda-forge

conda config --add channels defaults

conda config --add channels r

conda config --add channels bioconda

安装R：

conda install r

等个几分钟左右，R就安装成功，Anaconda安装R默认的是3.2版本的，但是目前我们基本上不怎么用3.2版本的了，可以使用Anaconda对R进行升级。

升级命令：conda update r r=3.5.2

两分钟左右，就升级成功了。其实如果在前面安装R的时候，选择r版本了，后面就不需要再升级了。

5.conda安装R包

如果出现如下报错，找不到x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc：

安装R包出现的报错

这是由于Anaconda把很多linux命令都自己做了，可按照官网安装相应的gcc（https://conda.io/docs/user-guide/tasks/build-packages/compiler-tools.html）。有如下版本：

不同版本的gcc

这里我安装了gcc_linux-64，命令：conda install gcc_linux-64，安装成功。但是安装R包还是报错，还是报错找不到x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc，折腾了半天，后边才发现，我在之前安装的时候没有有将Anaconda添加到环境变量中，因此出现不能调用x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc，然后将/my/home/Anaconda3/bin/添加到~/.bashrc即可正常安装R包了

conda安装R包有两种方式，一种是使用conda命令安装：conda install -c r package-name，需要注意的是conda下面的r包的名称与普通R包的名称不一样，具体名称可以在官网上面查询（http://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/）；另外一种是直接进入conda下面的R交互界面，安装普通安装R包的方式进行安装，比如bioconductor或者install.packages方式。

Anaconda安装的R自身带的R包比较少， 用命令（.packages(all.available=T)）查看自带的基础包，可用的包只有52个，像常用的ggplot都没有，因此需要安装很多基础包，如果一个一个的安装，实在是太麻烦，Anaconda提供了一个快捷安装很多基础包的命令：conda install -c r r-essentials，里面自带了100个常用的科学计数包。查询conda官网的R包的链接如下：http://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/。

6.结束语

困扰几天的问题终于解决，如释重负。本来要上传几张安装过程、成功的图片，可惜正在安装R包，没法截图。

参考网站：

https://www.anaconda.com/download/

https://chrisconlan.com/installing-r-python-anaconda-biologists/

https://stackoverflow.com/questions/46036821/install-conda-for-r

https://www.jianshu.com/p/2f3be7781451

http://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/