【生信训练营-4】GenomicRanges入门
2016-09-18 本文已影响1176人
Rapp
今天介绍的GenomicRanges包是建立在IRanges包的基础之上，能够为BioC中很多其他的软件包提供支持，在基于R的基因组学分析中占有十分重要的地位。
学习GenomicRanges包的主要任务是掌握3个类：GRanges, GRangesList 和 GAlignments
- GRanges代表的是基因组上的一组区间范围（比如一个基因的所有exon）
- GRangesList代表的是基因组上多组区间范围（比如多个基因的exon）
- GAlignments代表的是基因组序列比对结果（比如将short reads比对到基因组上）
我根据GenomicRanges的文档制作了一个简单的入门教程和大家分享：
granges.jpg
访问地址：http://112.74.107.44/bioc/Learning_GenomicRanges.html
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