molecular biology

问题 4. 热图样品的 ID 顺序怎么变了?

2020-02-18  本文已影响0人  生信石头

问题

不时会遇到这类问题


大体即,绘制热图之后,发现样品顺序跟输入的顺序不同,往往用户会希望调整回原来的顺序。

解决

事实上,这不算 TBtools 的使用问题。因为只要是绘制热图的工具,都会有类似的情况。而这种情况,其实又不应该认为是问题
因为有这个疑问的用户,往往或者是新手,或者是一时反应不过来热图的绘制参数。

我们使用示例数据,展示一下



点击绘制热图



你会发现ID,完全没问题
但是,往往我们还有调整另外的参数,比如

可以发现


列名顺序被改变了。
所以,比较清晰,顺序改变,是聚类的结果。一旦聚类,那么就一定会有某种指定顺序,而往往不会是跟输入的顺序完全相同。
于是,这问题已经解决。

题外

事实上,我们说的聚类一定会指定某种顺序,但是其实存在一些顺序是等价的【注:仍然几乎不可能跟你输入的顺序完全相同】。我具体指的是


这两个分支前后调换,其实是等价的。具体我以前已经写过教程了。详细见:
热图聚类位置不如意?你动手调啊...
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