2019年7月week3 HPV16 时间线性取样 宫颈癌+癌前

Abstract

人乳头瘤病毒（HPV）的进化速率对于靶向HPV的癌症预防策略至关重要。 我们前瞻性地分析了原位（CIS）和浸润性鳞状细胞癌（SCC），基于人群的巢式病例对照研究随时间的变异性。
在1969 - 2002年期间在瑞典参加宫颈筛查的757690名女性中，94名女性在两个连续宫颈筛查样本中持续HPV16持续存在（中位数间隔24个月，范围0.5-178个月），后来被诊断为CIS（n = 59） ，SCC（n = 32）或保持健康（n = 3）
全HPV16基因组测序和序列样品中序列的比较显示，所有女性在两次连续涂片中具有相同的HPV16谱系，特别是谱系A。 在这两个样本中，百分之五十六的女性具有相同的7906碱基对HPV16序列，并且没有女性具有超过15个核苷酸取代。 中位替换率为0个替换/位点/年（置信区间0-0.00008），随访四分位数之间没有变化。
我们的结论是，在大多数患有HPV16持续性疾病的女性中，核苷酸替代率在长达15年的随访期内未检出。 这种缓慢的进化速率对基于HPV的筛查和HPV疫苗接种具有重要意义。

Methods

石蜡标本 - PCR - HPV 16 genome 测序

标本信息 SNP随时间的变化统计 与week2文献比较