在R里面读取数据的8种方式,还有速度的比较

2018-12-25  本文已影响27人  因地制宜的生信达人

在R里面读取数据的8种方式,还有速度的比较

原贴来自于生信技能树论坛:http://www.biotrainee.com/thread-1588-1-1.html

你还在用read.table?read.csv吗?

有博客比较了:

utils::read.csv
readr::read_csv
data.table::fread
base::load
base::readRDS
feather::read_feather

这些函数,具体比较结果建议大家直接看原文吧,反正也没有啥难的。

https://www.r-bloggers.com/fast-data-loading-from-files-to-r-2/

喜欢用sqlite, 完全不需要读取全部文件呀, 在shiny APP里面。

读大文件我会使用data.table::fread 那速度是没的说。

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