！备忘，方便自己查询，随着使用更新，无参考价值。

Function reference
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ggplot2: elegant graphics for data analysis 3rd edition
《R语言数据可视化之美》配套代码
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1. 基础

• ggplot()

一些想法：
1. ggplot要有两个思想，图层和映射；
   图层的前后，达到的效果可能不同
2. 有许多冗余的功能，但要注意这些功能的细微区别；
3. 多看别人的绘图代码，提高对ggplot的理解和学习如何呈现自己的数据；
4. 不需要掌握所有参数，不需要直接生成最终版本的图，哪怕用`AI`再修；
5. ggplot的扩展包很多，不可能都完全学会，总体把握下，学习自己需要的；
6. ......

2. 绘图 geom_*

2.1 一个连续型变量

• geom_area()
• geom_density(): 密度图
• geom_dotplot(): Wilkinson点图
• geom_frepoly(): 频数多边形
• geom_histogram(): 直方图
• geom_qq()

2.2 一个离散型变量

• geom_bar(): 柱状图/条形图

2.3 两个连续型变量

• geom_label()
• geom_point(): 散点图、气泡图
• geom_quantile()
• geom_rug(): 边际地毯
• geom_smooth()
• geom_text(): 添加文本

2.4 一个离散型，一个连续型

• geom_col(): 条形图/柱状图
• geom_boxplot(): 箱线图
• geom_dotplot():
• geom_violin(): 小提琴图

2.5 两个离散型变量

• geom_count()
• geom_jitter()

2.6 添加线

• geom_segment()
• geom_hline(): 添加横线；geom_vline(): 添加竖线；geom_abline(): 添加有角度的线

2.7 误差

• geom_crossbar()
• geom_errorbar()
• geom_linerange()
• geom_pointrange()

注意一些参数

• position
dodge: 避免重叠，并排放置
  fill: 堆叠图形元素并将高度标准为1
  identity: 不做任何调整
  jitter: 给点添加扰动避免重合
  stack: 将图形元素堆叠起来
  参考：ggplot2位置调整position
• stat
• fill, color
  注意区分
• group

3. 统计 stat_*

• stat_smooth()
method = lm: 添加线性回归线

- `stat_bin()`、`stat_bin_2d()`、`stat_bin_hex()`
- `stat_sum()`、`stat_count()`、`stat_summary()`、`stat_summary_bin()`、`stat_summary_hex()`、`stat_summary_2d()`
- `stat_boxplot()、stat_density()`、`stat_ydensity()`、`stat_density_2d()`
- `stat_ecdf()`、`stat_identity()`、`stat_unique()`、`stat_function()`、`stat_qq()`、`stat_ellipse()`、`stat_contour()`、`stat_quantile()`

4. 标度scale_*

4.1 离散型变量颜色填充scale_fill_*、scale_color_*

• scale_fill_discrete(), scale_colour_discrete(): 色轮周围均匀等距色（同hue）
  guide
name
• scale_fill_hue(), scale_colour_hue(): 色轮周围均匀等距色（discrete）
• scale_fill_grey(), scale_colour_grey(): 灰度调色板，标度范围0 ~ 1（黑色 ~ 白色），默认0.2 ~ 0.8
  start = 0.7
end = 0
• scale_fill_brewer(), scale_colour_brewer(): ColorBrewer调色板
  palette = "Set3"
• scale_fill_manual(), scale_colour_manual(): 自定义颜色
  values = c("red", "blue")
values = c("#CC6666", "#7777DD")
values = c(female="red", male="blue")
• scale_alpha(): 透明度

4.2 连续型变量颜色填充scale_fill_*、scale_color_*

• scale_fill_gradient(), scale_colour_gradient(): 两色渐变
  low = "black"
high = "white"
• scale_fill_gradient2(), scale_colour_gradient2(): 三色渐变
• scale_fill_gradientn(), scale_colour_gradientn(): 等间隔的n种颜色的渐变色
  colours = c("", "", "", "")
• scale_alpha()

4.3 形状大小

• scale_shape()
• scale_shape_manual()
• scale_size()
• scale_size_area()
• scale_linetype()
• scale_radius()

4.4 坐标相关

• scale_x_discrete(), scale_y_discrete():
  limits =:
  breaks =: 设置刻度线的位置
  labels =: 修改刻度标签文本
• scale_x_continuous(), scale_y_continuous()
• scale_x_reverse(), scale_y_reverse()

5. 坐标 coord_*

• coord_fixed(): 设置x轴和y轴的缩放比例
  ratio = 1/2
• coord_flip(): 翻转坐标轴
• coord_cartesian():
  xlim =
ylim =
expand =
• coord_map():
• coord_quickmap():
• coord_trans():
• coord_polar(): 极坐标

6. 主题 theme_*

• theme_gray(): 默认主题
• theme_bw()、theme_classic()、theme_void()

- `theme_dark()`、`theme_light()`、`theme_linedraw()`、`theme_minimal()`

• theme_set(): 设置当前R会话下的默认主题，如：theme_set(theme_bw())

7. 分面 facet_*

• facet_grid()
• facet_wrap()

8. 细节

8.1

• annotate()

• labs()
title: 主标题
  subtitle: 副标题
  caption: 设置图例标题
  colour/fill

• guides
  guide_colourbar
  guide_coloursteps
  guide_legend
  guide_bins
  guide_axis
  fill = guide_legend(reverse = TRUE): 反转图例的顺序
  fill = guide_legend(title = "legend title"): 设置图例标题

8.2 函数外设置

• ggtitle()
• xlab()
• ylab()
• xlim(): 设置连续型x坐标轴值域，scale_x_continuous()的简便写法
• ylim(): 设置连续型y坐标轴值域，scale_y_continuous()的简便写法

8.3 主题元素

• theme()

1. 文本元素，如，所有文本元素text = element_text()
   1.1 family:
   1.2 face: 字体
   1.3 colour: 文字颜色
   1.4 size: 字体大小
   1.5 hjust: 横向对齐
   1.6 vjust: 纵向对齐
   1.7 angle: 旋转角度
   1.8 lineheight: 行间距倍数
   注意：文本几何对象的文本属性与主题元素的基本一致。除了字体为fontface。

其他文本元素：
`plot.title`: 标题文本外观
`legend.text`: 图例项文本的外观；`legend.title()`: 图例标题
`axis.title`: 双轴标签的外观；`axis.title.x`: x轴、`axis.title.y`: y轴
`axis.text`: 双轴刻度标签的外观；`axis.text.x`: x轴；`axis.text.y`: y轴
`strip.text`: 双向分面标签的外观；`strip.text.x`: 横向；`strip.text.y`: 纵向

在书上看到axis.ticks与axis.text一样，也用于双轴刻度标签外观的设置，但不知道为啥用了没效果。

2. 矩形元素，如所有矩形元素rect = element_rect()
   2.1 colour:
   2.2 fill:
   2.3 size:

其他矩形元素：
`plot.background`: 整个图形的背景
`panel.background`: 绘图区域背景；`panel.border`: 绘图区域边框
`legend.background`: 图例的背景；`legend.key`: 图例边框
`strip.background`: 分面标签的背景

3. 线条元素，如所有线条元素line = element_line()

其他线条元素：
`axis.line`: 坐标轴线
`panel.grid.major`: 主网格线；`panel.grid.major.x`: 纵向；`panel.grid.major.y`: 横向
`panel.grid.minor`: 次网格线；`panel.grid.minor.x`: 纵向；`panel.grid.minor.y`: 横向

4. legend.position = "right": 图例的位置，还可设置为"top"、"bottom"、"left"和c(1, 0)这样的位置坐标
   设置为"none"移除所有图例
5. legend.justification = c(1, 0)
   原图地址：https://henrywang.nl/ggplot2-theme-elements-demonstration/

9. 其他重要的相关的包

9.1 主题、颜色搭配

ggsci
cowplot

9.2 多图拼接

patchwork

9.3 统计运算

ggsignif