methylKit 统计方法
2020-08-20 本文已影响0人
horsefish
methylKit可以用来寻找DMR/DMC,其统计方法如下:
- logistic regression
- Fisher exact test
有重复时methylKit调用 logistic regression,无重复时调用Fisher exact test
methylKit也有自己独特的p-adjust方法SLIM
用户也可以根据自己的需要选择传统的BH等p值校正方法。
methylKit可以用来寻找DMR/DMC,其统计方法如下:
有重复时methylKit调用 logistic regression,无重复时调用Fisher exact test
methylKit也有自己独特的p-adjust方法SLIM
用户也可以根据自己的需要选择传统的BH等p值校正方法。