自噬相关基因集合

2022-09-03  本文已影响0人  生信交流平台

前面小编给大家介绍过几个研究热点相关的基因集

m6A甲基化相关基因集

铁死亡相关基因集

SCI文章中经常出现的免疫相关基因集

科研新热点——血管生成相关基因

今天小编就跟大家聊聊另外一个科研热点—自噬。Autophagy(自噬)来自于希腊语,是auto=self和phagy=phagein=to eat的结合。细胞是怎么吃掉自己(self-eating)的呢?大致是一个通过膜将部分胞质和细胞内需降解的细胞器、蛋白质等组分包裹起来形成自噬体,后与溶酶体融合形成自噬溶酶体,最终降解其所包裹的内容物的过程。

自噬的本质其实是细胞内的膜重排,其发生过程大体分为以下4个阶段:自噬的起始→ 隔离膜和自噬体的形成→ 自噬体与溶酶体融合→ 自噬体的裂解


自噬的发生过程(Li et al. Molecular Cancer, 2020)

我们可以从HADb(Human Autophagy Database)http://www.autophagy.lu/index.html获取自噬相关的基因。

在这篇文章的方法部分,我们可以清楚的看到作者从Human Autophagy Database数据库获取了222个自噬相关的基因。


接下来小编就带大家一起来获取自噬相关的基因集合

1. 打开HADb的主页,http://www.autophagy.lu/index.html

2. 点击Clustering菜单,你会看到自噬相关的基因按照首字母顺序排列。


3. 将所有的基因拷贝粘贴到Excel中,简单的整理一下,就可以得到最终的232个自噬相关的基因。这里得到基因数比前面提到的SCI文中显示的222个基因要多,原因可能是数据库更新了。那篇SCI文章是2021年发表的,而我们是2022年9月1日从数据库中获取的。


获取完整基因列表☟☟☟

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