Count分析基因Gain/Loss/Duplication
2021-05-13 本文已影响0人
胡童远
文献
标题：Count: evolutionary analysis of phylogenetic profiles with parsimony and likelihood
中文：具有简约性和似然性的系统发育谱的进化分析
杂志：Bioinformatics
时间：2010
引用：280
地址：http://www.iro.umontreal.ca/~csuros/gene_content/count.html
java程序可直接使用
引用文章
文章：Insights on the Evolutionary Genomics of the Blautia Genus: Potential New Species and Genetic Content Among Lineages. Frontiers in Microbiology 2021
方法：
Orthofinder的基因家族结果用于count计算基因gain loss，使用 Csûrös - Miklós模型和泊松分布
结果：
