文献阅读-nomogram文章(四)
题目:《Nomogram for Preoperative Estimation of Microvascular Invasion Risk in Hepatitis B Virus–Related Hepatocellular Carcinoma Within the Milan Criteria》
一.研究背景
既往术前预测乙肝相关肝癌有无微血管浸润(MVI)的方法都有一定的局限性,需要一种新方法在术前预测肝癌有无MVI,这对于术式的决定很重要。
二.研究方法
1.纳入病人
按纳入标准和排除标准,前瞻性地纳入2004.4-2008.10的707个病人作为训练集,2008.10-2011.2的297个病人作为测试集。
疑问:这种按时间划分训练测试集的方法,是否会存在因时间不同导致的选择偏倚?将所有病人均纳入后按7:3随机分为训练测试集是否为更好的方式?
2.定义随访终点
这是一项前瞻性研究,包含了对病人的随访,定义随访终点为Overall survival(总生存期)和time to recurrence(复发时间)。
3.纳入自变量
包括生化指标、影像指标等。
4.统计方法
基线资料对比:连续型变量用t检验和Mann-Whitney秩和检验;分类变量用卡方检验或Fisher精确检验。用KM法计算生存曲线,用logrank检验比较生存曲线。
三.结果
1.数据预处理
这篇文章将很多连续型变量都处理为了二分类变量,例如HBV载量以10000位分界,PLT以300为分界,AFP以20和400为分界处理成了三分类变量。
2.Logistic模型建立
在训练集里,以有无MVI为响应变量,进行单因素logistic回归分析和多因素logistic回归分析,最终选定7个自变量,纳入nomogram画图中。
3.cox模型
以OS和TTR为终点,分别在训练集和测试集里进行单因素和多因素cox回归分析。这篇文章是以有无MVI为终点的,因此这一步只在两个数据集里进行了cox回归分析,无后续验证画nomogram图等分析。
4.验证nomogram模型表现
4.1区分度
计算c-index。
4.2校准度
画validation plot。
4.1和4.2分别使用Bootstrap重抽样法;
4.1和4.2分别在训练集和测试集中进行:
验证模型
4.3临床应用价值
logistic模型的临床应用价值,可以通过诊断试验来实现:
临床效能评估