生信星球培训第六期

学习小组Day5笔记--纸心

2018-09-21  本文已影响3人  纸心_67f1

向量和标量

接下来的内容来自生信星球,感谢豆豆花花

向量和标量的区别
用c()函数来创建向量,例:x<-c(1:10)

数据框

用data.frame()函数来创建数据框,例:x<-data.frame("x","y")

读取本地文件(数据输入)

用read.table()函数或read.csv()函数
例:a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

数据框的导出(数据的输出)

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)

提取元素

1.从向量中提取

熟用中括号

x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了……
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素

2.从数据框中提取

- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列(横着写,这是不够懒也不够优秀却能存在的写法)
- X[y] #第y列(竖着写,这是懒惰又优秀的写法)
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)

变量的保存和重新加载

#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令
思维导图
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