Notepad++ 正则表达式 | fasta 文件

Notepad++ 常用的处理文本的正则表达式

1. 在每行开头加16进制颜色

查找：^
替换：#FFB6C1

2. 合并多行代码为1行

查找：[\r\n\t]
替换：

3. 去除特定字符冒号:之前的所有字符(不包括>)。

原始文件:

>TraesCS6B02G079100:TraesCS6B02G079100.1
ATGTACCGTTGTGCTGTGGTCTTTCTGATCGTGGTGGCCGCCTGCACTCCGGCCATGAGCAGCTTTTGGCAGCAGGCCCTCCCGGCCTTGTG
>TraesCS3D02G280460:TraesCS3D02G280460.1
ATGGATAGGCTCGTCGCCGCCGGCATCCTTGGCTTTCTACTGATTGCGTCGGTAGGAAGCCAGGCAGCTCGTGCTCCGGAGCAATACTGGAAGTCTGCTCTTC

• 1. 方法一
     查找：.*\:
     替换： >
• 2. 方法二
     查找：([A-Za-z0-9]*)(\:)([A-Za-z0-9]*\.[0-9])
     替换：\3

☝注意：其实方法二更加精确！

替换后:

>TraesCS6B02G079100.1
ATGTACCGTTGTGCTGTGGTCTTTCTGATCGTGGTGGCCGCCTGCACTCCGGCCATGAGCAGCTTTTGGCAGCAGGCCCTCCCGGCCTTGTG
>TraesCS3D02G280460.1
ATGGATAGGCTCGTCGCCGCCGGCATCCTTGGCTTTCTACTGATTGCGTCGGTAGGAAGCCAGGCAGCTCGTGCTCCGGAGCAATACTGGAAGTCTGCTCTTC

4. 删除特定字符: 之后的所有字符(不包括:)

• 1. 方法一
     查找：\:.*$
     替换： >
• 2. 方法二
     查找：([A-Za-z0-9]*)(\:)([A-Za-z0-9]*\.[0-9])
     替换：\1

替换后:

>TraesCS6B02G079100
ATGTACCGTTGTGCTGTGGTCTTTCTGATCGTGGTGGCCGCCTGCACTCCGGCCATGAGCAGCTTTTGGCAGCAGGCCCTCCCGGCCTTGTG
>TraesCS3D02G280460
ATGGATAGGCTCGTCGCCGCCGGCATCCTTGGCTTTCTACTGATTGCGTCGGTAGGAAGCCAGGCAGCTCGTGCTCCGGAGCAATACTGGAAGTCTGCTCTTC