scRNA单细胞测序

单细胞转录组学习笔记-6-课程文献再理解

2020-02-23  本文已影响0人  天涯清水

癌症相关的成纤维细胞 (CAFs)是肿瘤微环境的主要组成部分,由于明显的异质性,它们在疾病开始、发展和治疗反应过程中的起源和角色仍不清楚。在这里,我们对乳腺癌小鼠模型中的间充质细胞进行单细胞转录组测序,得到了768个样本数据,结合负向选择策略定义了CAFs的三个不同亚群。利用几个小鼠模型和人类肿瘤样本进行转录水平和蛋白水平的验证,揭示了CAFs亚群在空间上的分离可归因于不同的起源,包括血管周围微环境、乳腺脂肪垫以及转化的上皮细胞。每一种CAF亚型的基因谱与特定的功能相关,另外利用它与转移性疾病的关联,临床上也可用来进行独立的预示。因此我们得到结论,如果目前广义的CAF群体分辨率得到提升,那么可以为生物标志物驱使的CAFs精确靶向药物开发提供可能性。

参考
人工翻译一篇重要的文献-scRNA+breast CAFs - 简书 https://www.jianshu.com/p/587b2d829b1b
单细胞转录组学习笔记-2-文献理解 - 简书 https://www.jianshu.com/p/9288e60f4c75

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