GephI美化蛋白互作网络
2023-03-30 本文已影响0人
余绕
1.把蛋白IDs提交至String，并 互作获得蛋白互作信息。
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2. 准备GephI数据
1.互作数据
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其中Weight 是combined_score，Source和Target分别为Node1和Node2。
2. 属性数据
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其中Id是互作数据中Surce和Targe的所有Ids。
3. 导入数据
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注意互作数据导入的是边表格，分隔符注意一下，，
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导入数据之后，选择预览，然后点击布局，选择Fruchterman Reingold
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4.导入属性文件
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5. 设置分类
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上一步产生分类数据
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6.设置点的大小
1.手动输入固定值
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2. 根据属性文件设置
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7. 添加蛋白名称
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