在玉米的基因或基因组研究中常常需要用到基因ID转换的问题，这里我将用的方法介绍一下：

1. 部分ID新旧版本基因组的基因ID转换—网页版

ID History Converter

仅支持旧版本到新版本的ID转换

Translate Gene Model IDs

支持输出数据库支持的任意基因组版本的ID转换，需要自行选择输出的基因组版本

也支持基于ID到EntreZ ID、Genebank ID、Genebank accessions的转换
如果不清楚列表中的基因组版本什么意思，可以在该网页继续往下看，查看Download By Region and Gene Model Set模块中的下拉菜单，对各个基因组的版本解释较为详尽。

2. 全基因组ID转换
   如果你需要全基因组ID转换，或者希望获取全部数据在本地实现转换。也是可以的。
   在Translate Gene Model IDs - download模块提供了全部ID转换列表的下载。
   文件包含了v3基因组的gene_model、起始位点、染色体信息、genbank ID、转录本ID、v1版gene_model、v2版gene_model、v4版gene_model、EntreZ ID、高粱、水稻、谷子的直系同源基因的ID、其他玉米基因组的ID。
   有了这个文件，进行功能研究就很方便了。

可以将旧文献中的基因ID与现行版本基因组的ID对应起来分析，可以和高粱、水稻等作物进行功能比较，可以使用EntreZ ID 进行GO、KEGG分析。