Bioconductor的镜像修改
2020-01-09 本文已影响0人
城管大队哈队长
今天突然发现一直能用的BiocManager::install很慢，好像一直加载不出来。刚开始还以为是实验室的网不行了，但 install.package()的包却很快。所以我怀疑可能是Biocondutcor的镜像问题，问了师兄之后才知道如何设置Bioconductor的镜像。
# 输入下面这个命令，然后就会跳出来选项让你选。选6即可
> chooseBioCmirror()
Secure BioC mirrors
1: 0-Bioconductor (World-wide) [https]
2: Japan (Tachikawa) [https]
3: Japan (Wako) [https]
4: Australia (Sydney) [https]
5: CRAN ASIA (Korea, Japan and Singapore) (Seoul) [https]
6: China (Peking) [https]
7: (other mirrors)
Selection: 6
在改完镜像之后，果然体会到了飞一般的速度╮（╯＿╰）╭。
当然我们也可以在 ~/.Rprofile 里直接修改。
# 打开.Rprofile
file.edit('~/.Rprofile')
# 这是清华源的镜像
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
另外附上Bioconductor的其他镜像：镜像地址
参考
