R作图

EdgeR与DESeq2的效果比较

2020-10-07  本文已影响0人  生信编程日常

求差异表达的软件有很多,关于谁的效果更好也一直被广泛讨论。最近有人比较了一下Edge R与DESeq2的效果,并提供了相应代码(http://genomespot.blogspot.com/2020/10/edger-or-deseq2-comparing-performance.html):

DE analysis:


韦恩图:


与其他软件比较:


UpSetR可视化结果:


大家有兴趣可以翻看一下~

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