启动子以及转录因子预测

在别个大神那里看到的方法，免得忘了，写个自己能懂的笔记。原文章https://mp.weixin.qq.com/s?src=11&timestamp=1614829597&ver=2925&signature=Nk6gYbvOy1oLxfLLRebtKG1gExdskrmR9WyVRSTikRE0BrPODMgfZMj5Bmt9ujn97ljEe7mdTEwdgV4c5stlLFmSYe153xt8kxpKXHRlbr2g7X0Xn9C*xotKu3A0BZ9i&new=1

有要看的去原创，我的比较简单方便我自己操作，毕竟人老了记性不好。

启动子预测网站：http://genome-asia.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway redirect=manual&source=genome.ucsc.edu

输入自己的基因 点击进入 点击进入 设置前2000和后100为启动子区域

submit

输出启动子结果

转录因子预测网站：http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3

1.select species

人类或者其他， submit

2.select factor

可以选择自己感兴趣的转录因子，submit

3. search site

把1中的启动子序列吧唧进去，submit

左上角的15可以修改，越小结果越少。

输出结果，只看到一个