学习小组Day3笔记--LA
2020-03-23 本文已影响0人
黑森林深处的小星星
1.conda镜像的安装
conda是用于下载APP的linux软件,miniconda就足够我们使用了
- 1 进入conda的网站
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
- 2 根据服务器的版本进行选择,运行
uname -a
- 3 cd 安装的文件夹,运行wget
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- 4 激活
conda source ~/.bashrc
- 5 验证
conda
出现这个就成功了 image.png - 5镜像,相当于主网站的副本,conda在国外,我们国内安装镜像会加快软件的下载速度。清华镜像和中科大镜像。
# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
2.软件的安装
- 1
conda list
查看所有软件列表
conda search fastqc
查找软件fastqc。 - 2
conda install fastqc -y
自动安装软件 - 3
conda remove fastqc -y
- 4 删除miniconda
rm -rf ~/miniconda3
,环境变量中去掉conda