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芯片的表达数据为负值?

2020-03-02  本文已影响0人  天涯清水

芯片的表达数据为负值?

隔离期间分析数据时发现有些芯片的数据的表达量归一化(未取对数)后还是负值;当时认为是芯片类型的问题,今天发现有人也遇到了这个问题,我就学习了一下:
是双通道芯片的选用的不同方法进行的归一化。

对于双通道数据而言,该方法通过把待标准化芯片上的所有对数比值减去该芯片管家基因对数比值的中位数来进行。对于单通道数据,则比较待标准化芯片和参照芯片上管家基因的差值,然后把待标准化芯片上的信号强度减去这一系列差值的中位数。基因芯片小知识(二)--数据分析

顺便又复盘了一下芯片的基础知识:

基因芯片小知识(一)--背景介绍

基因芯片小知识(二)--数据分析

基因芯片小知识(三)--分类比较

基因芯片小知识(四)--分类方法

基因芯片小知识(五)--分类预测中的标准模型(1)

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