使用迅雷下载SRA文件
2020-09-08 本文已影响0人
Decoding_Bugs
使用sratoolkits下载的时候一直报错,按照网上之前的一个说法更改链接的后缀,打开迅雷的时候,文件显示一直是0B,于是还是自己摸索了一下,下载成功了。下面以这篇文章为例,进行SRA数据的下载。
Front. Physiol., 18 February 2020 | https://doi.org/10.3389/fphys.2020.00106
An Overview of Embryogenesis: External Morphology and Transcriptome Profiling in the Hemipteran Insect Nilaparvata lugens
原始数据提供的链接为
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA579876
点击这里的SRA进入数据页面

一共有8个数据,选择第一个进入,点击SRR编号

点击data access后,复制链接到迅雷里面打开就可以下载了。

当然目前这个方法是属于比较笨的方法,只能一个一个的下载,对于数据量不大的情况,是可以接受手工操作的。如果牵涉到上百条数据的下载,目前我还没有好的解决方法,