文献翻译

DLC-1 down-regulation via exosom

2020-04-23  本文已影响0人  一个没有感情的文献阅读机

本文选自Clinical Science,https://doi.org/10.1042/CS20191087,喜欢的朋友可以下载学习。不废话,上图。

这篇文章是5分文章,基本不用读具体做的内容,大概也能猜出做了些什么东西,低分文章,只做一般解读,大部分都会存在一些这样那样的问题,我们来一起学习一下,看看作者是不是人帅自有天帮!!!!

二话不说,作者上来就整miR,这个不是来自自己的数据,就是挖别人的,或者是别人研究过的,移植过来再研究的。本文作者是自己测的血清中肺转移和非转移CRC差异表达的miR,然后在组织中验证了一波,确定了本文要研究的miR-106b-3p,通过对这个miR命名,可以了解,这个miR存在很长时间了,发现的比较早。作者在血中分别验证了5种miR的表达水平变化,然后选了本文要研究的miR在组织中验证了一波。这样就选定了我们要研究的miR,看了这么多文章了,最后还是靠倍数取胜,没有别的,就是直接而已。

有些人选好了就做机制,有些人做功能,有些人做表型,反正做什么的都有,做机制的最少,上来做机制,没有表型的话很容易投不出去,做功能,表型的还是多数,但是上来做机制的一般都是高分文章,这种文章偏向科研型,做功能、表型的,这种偏临床,发的文章普遍不高。这种5分的,你应该知道该做什么下一步。安排一波表型和功能看看。这里做到的表型无非就是EMT相关表型。作者显示做了功能试验,发现miR高表达与正常组织和转移组织都有差异,而且血浆和组织中miR表达也有相关性,术前术后也有差异,高表达与生存具有负相关性。文中作者发现不同细胞系表达也有差异,这种多好,为后续做敲减和过表达都方便,不像我的实验,清一色的低表达,心里苦啊。

作者做完功能,可以做表型了,归结起来就是高表达抑制,低表达的过表达,然后就是常规一些实验验证表型。其中ABC是transwell实验,G图做的是CCK-8,不过看不出来有差异啊,所以细胞侵袭改变并不改变细胞的凋亡,常规的EMT相关的蛋白marker,作者这是缺钱吗?验证个外泌体都用四个蛋白,验证个主要的EMT居然用三个,不知道作者主要想做什么。这让我想到了我上一篇文章中说的,他们是把高表达和低表达的在一起共培养,然后可以发现低表达的也高表达了,从而做的表型实验,我觉得这样更好,尽量减少对细胞的操作,可以最大程度的反应细胞本身的特性。

该做的都做差不多了,本文还剩下的就是机制和动物表型验证了,一点一点来,机制部分上图,我都不想解释什么了,都是套路。无非就是靶点突变,RIP下拉验证,在细胞水平做做靶蛋白的表达相关的实验。

下面作者神奇的验证了我上面说的内容。也就是说明在不同肿瘤之间的外泌体是可以相互传递货物的。这种传递是直接传递外泌体成熟的miR,而不是pre或者pri形式的。

下面就迷之科幻了,作者把前面做蛋白的部分又重做了一遍。用外泌体处理SW480细胞作者称为STIMULATE.

最后到动物了,一目了然的结果。

文章到此也就结束了,请问为什么作了靶点预测,而且细胞水平靶点有功能,但是在组织水平中有没有进行验证靶点的功能,而仅仅只是作了miR的功能呢?还有,我觉得作者做的过表达miR的表型简直就是多余啊,做了但是没有用到啊,如果那部分去掉,都不影响文章结构,这做着又有什么意义呢,再者,既然题目中都说了EMT,为什么动物中不验证一下EMT相关的指标呢?我再次感觉到了文章编排的顺序其实比你文章的思路更重要,编排的好,应该可以再上2-3分。这篇文章不如直接从选了miR开始做表型,然后再做靶点功能,紧紧围绕靶点和EMT的关系进行下一步实验,直到动物实验,做完以后可以进一步分析临床相关性,文末再次点题研究的意义,这样显得文章比较有新颖性,要不然就是一种已知结果然后寻找原因的研究,缺乏了发现新事物的新鲜感。多有不到之处,欢迎大家批评、指正。

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