KEGG富集分析—柱形图，气泡图，通路图

前面给大家介绍过如何用一些简单易用的网页工具去做GO和KEGG富集分析

☞富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO

☞比DAVID强一万倍的基因注释工具

☞GO，KEGG富集分析工具——DAVID

也给大家介绍过如何用R做GO富集分析和结果可视化，以及如何将富集结果中的gene ID转成基因名字

☞GO富集分析四种风格展示结果—柱形图，气泡图

☞GO和KEGG富集结果如何显示基因symbol

还有计算富集倍数的三种方法

☞GO和KEGG富集倍数（Fold Enrichment）如何计算、

今天小编就接着来聊一聊如何用R做KEGG富集分析，并展示柱形图，气泡图和通路图。KEGG富集分析的结果相对于GO富集分析来说，要简单一些，不会再分成更多的类别。KEGG的富集结果就只有一个类别，所以展示起来也相对容易一些。

柱形图

气泡图

KEGG通路图

pdf格式，矢量图，红色基因上调，绿色基因下调

png位图，KEGG官网样式的通路图，但是只能导出为png格式，很多杂志是不接受png格式图片的。但是小编确实在SCI杂志文章中看到过这种样式的图片。所以这个要看具体杂志的要求了，或者可以去做一些格式转换。

我们还能批量的导出KEGG富集分析结果中，最显著的前10个通路的通路图

☞完整的GO/KEGG富集分析及绘图代码的视频讲解

KEGG富集分析—柱形图，气泡图，通路图