2 ***** ***** ERROR: Requested c
2022-12-05 本文已影响0人
白米饭睡不醒
使用bedtools时报错：
***** ERROR: Requested column 10, but database file - only has fields 1 - 8.
解决方法：
bedtools intersect -a enhancers.bed -b down.bed -wa -wb | bedtools groupby -i - -g 1-5 -c 10 -o collapse > enhancers-down.txt
将命令中的-c 10 改为-c 8
这里 -c指定特定的需要进行统计的列. 必须参数
这里的 -c 指的是两个定位文件匹配到一起后的列数
