IGV展示gff文件
2020-05-15 本文已影响0人
扇子和杯子
1. 加载基因组文件
Genomes➡️Load Genome from File➡️点击自己的基因组
2.加载gtf/gff文件
2.1. Tools➡️Run igvtools
2.2. File➡️Load from File➡️ *.sorted.gff
3. 大功告成
备注:有些文章说,sort之后还要做index。我做index再导入的话会报错,用上面这种方法就可以解决。好玩的是,有时候导入sorted文件,它会说你没做index,那你点击GO就可以了;不报警报的话就直接导了。
附录:发现了一篇讲igv很详细的文章https://www.jianshu.com/p/9221ce6c5092