科研汪的日常 20 效率与冗余
科研汪在熬了个大夜之后好不容易将汇报的PPT做完,长呼一口气将电脑了关机,然而电脑刚关,脑子就轰地一响,看来今晚注定是个不眠之夜。
有了这次教训,赶紧百度,打开了WPS的自动备份功能,也顺手将重要数据拷贝一份到移动硬盘里。看着几十个G的数据拷贝进度,心中不禁感叹,短短数月竟产生这么多的实验数据。
仔细想来发现,这里存在大量的冗余:实验过程中有技术重复和生物学重复,数据分析要有多角度和多参数,结果展示也有不同形式(或图表或图像,但都是对原始数据进行加工处理后所得)。毕竟实验操作存在误差,实验对象存在个体差异,数据分析存在主观性,同时有些信息在处理结果的过程中会被略过,因此必要的冗余保证了在一定程度上保证了资料的科学性和可溯源性。
然而,冗余虽好,同时也会产生一些问题:每次保存都会产生备份文件,时间久了会占用大量的储存空间,同时有多个备份,往往也给寻找关键版本增加了工作量。如何有效利用冗余做好备份,并提高效率是需要不断探索的新挑战。
于科研汪而言,在单次实验中尽可能多的设置对照实验,是尝试找到冗余和效率之间的平衡的努力。Western Blot过程中,一次实验跑四张膜,转印的时候让1号膜和2号膜同槽,3号膜和4号膜同槽;抗体孵育时让13号膜同抗体,14号膜同在背面(抗体孵育让两张PVDF膜背对背放入盛有抗体的孵育盒中)。由此可以实现在一次实验过程中,进行样品表达差异的检测的同时,对转印槽、抗体和孵育方式这三者对实验结果的影响进行比较,以此来为后续实验流程优化打基础。
做实验很简单,按着Protocol一步一步操作总能得到结果,但做好实验不容易。做好实验只能是个成熟的技术员,想要成为合格的科研工作者,仍前路漫漫,需砥砺前行。保持客观和谦虚,也许每一次意外都可能带来serendipity。
参考链接:
1.冗余:
https://baike.baidu.com/item/%E5%86%97%E4%BD%99/3687555?fr=aladdin
2.WPS怎么设置自动保存:
https://jingyan.baidu.com/article/597a06430698cb312b524383.html
3.Western Blot