GSEA分析之前Java环境搭建

2020-06-21 本文已影响0人生信小鹏

使用GSEA需要在Java环境下运行，所以搭建好Java运行环境应该是使用GSEA的第一步，虽然很多时候可以使用无脑搭建Java环境，安装GSEA，但是如果碰到一点问题，没有预计到，还是很头疼。所以这一篇文章就是记录一下个人GSEA运行时Java环境的搭建时遇到的问题。

1. Java下载

1.1 版本要求

GSEA的运行时要求在java 8下运行，有些电脑自带Java 11，这个时候就要自行下载Java 8 。下载地址https://www.oracle.com/java/technologies/javase-downloads.html

image.png
进入之后，选择相应的版本就可以。需要注册，用邮箱注册一个即可。

1.2 安装

可以是无脑安装，如果需要的话，可以自己改变安装位置，这是因为后面的环境变量的改变时需要用到。

1.3 环境搭建--环境变量

进入电脑的属性

选择高级设置

进入环境变量设置

环境变量中需要注意这两个变量的设置,一个是JAVA_HOME,另一个是PATH不区分大小写。系统变量如果没有这两个变量，可以自行新建。

变量设置参数如下：

变量名：JAVA_HOME
变量值：D:\Program Files (x86)\Java\jdk1.8.0_91
根据自己的实际路径配置，上面是我自己安装时的位置。
变量名：CLASSPATH
变量值：.;%JAVA_HOME%\lib\dt.jar;%JAVA_HOME%\lib\tools.jar;
前面有个"."
变量名：Path
变量值：%JAVA_HOME%\bin;%JAVA_HOME%\jre\bin;