学习小组Day-3笔记--丁览博
2020-03-18 本文已影响0人
丁览博

图片来自pad os端mindnode
Linux环境下软件安装
1.认识conda
Linux系统下的软件包管理器,类比于iPhone的app store
2.在服务器下载miniconda
到达生信软件目录下:cd biosoft
下载软件:wget *清华镜像网站复制的链接*
3.安装配置miniconda
3-1安装:bash M+tab键
3-2激活conda:source ~/.bashrc
3-3添加镜像: copy code and press enter
4.使用miniconda
4-1查看所有软件列表:conda list
4-2搜索软件:conda search software
4-3安装软件
- 自动安装:
conda install software -y
- 指定版本:
conda install software=6.6.2 -
4-4卸载软件:conda remove software -y
5.定制conda环境
5-1 查看当前环境:conda info --envs
5-2创建指定python版本并安装软件的conda环境
conda create -n rnaseq python=3 fastqc trimmomatic -y
5-3激活新的环境:conda activate rnaseq
`