celltalker：单细胞转录组配受体分析

在单细胞RNAseq数据可能进行的许多类型的分析中，是对假定的细胞间通信的评估。celltalker试图通过寻找已知的配体和受体对在细胞内和细胞间的表达来评估细胞间的交流(即“交谈”)。任何已知的配体和受体都可以使用，Ramilowski等人(Nature Communications, 2015)的出色工作描述了这一套配体和受体。我们建议使用这个配体和受体的列表作为起点，也可以收集自己的已知配体和受体的列表。另外，Vento-Tormo等人(Nature, 2018)的工作最近广泛策划了配体和受体，并将在cellTalker的未来版本中实施。

需要确定的是您的样本中是用受配体的，celltalker是一个R包，与seurat是兼容的。

celltalker教程

https://arc85.github.io/celltalker/articles/celltalker.html#summary

除了这个R包之外，还有其他的方法：

文献中也提到一种方法：
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S221112471831636X

cellphonedb:
https://www.cellphonedb.org/