GFAP---pfam_go_kegg模块

后来发现，即便努力实现了各科代表物种的注释，但在某些情况下还是直接注释可能更方便些。于是对GFAP添加了一个新的模块，该模块直接用pfam, GO, KEGG官网数据进行注释。但有两个小问题：一个是注释过程相对慢；二是这些功能只能用蛋白序列去实现。同学们可以根据自身情况灵活选择。注意，当使用的库是总库（即没有标注plant）时，是可以对除植物外的其他物种注释的。功能使用方法如下：

一共有三个数据库需要去我分享的账号进行下载，它们分别是植物专用pfam数据库，总的pfam文件（适用各物种）以及总的kegg文件（适用各物种）。点击①，②和⑦可自动链接到下载账号~

下载完成后，只需要将下载的数据库放到GFAP的文件夹下就可以进行使用了。例如：

这个操作再简单点儿说就是GFAP.exe在哪儿就放哪儿。

pfam和GO ID的生成：

完成上述操作后，需要告诉软件你放的是哪个数据库，点选之后（③），把蛋白序列文件放入规定位置（④），然后保存命名（⑤），点击⑥即可运行功能。kegg IDs的运行过程类似。

完成后，pfam的结果会直接给出功能。但GO和KEGG只会给出ID,接下来的操作就是到前面的模块该做什么做什么就好，例如：