科研信息学

snp 突变命名 速查

2019-01-17  本文已影响46人  Thinkando

① 错义突变表示方式(missense):W26C 表示26位的色氨酸(Tryptophan,W )变为半胱氨酸(Cysteine,C)。
② 无义突变表示方式(nonsense): W26X表示26位变为终止密码子(stop condon, X)
③ 起始密码子改变的表示方式:其实密码子的改变要么导致翻译起始位置后移(下一个ATG行使起始密码子的功能),要么导致蛋白无法被翻译出来,可以表示为 p.?(unknown,未知),如果实验没有对蛋白情况进行正式,那么表示为p.0

image.png

(1)插入/缺失(indels),就是插入缺失相结合的一种情况,具体如下:

(2)倒置(Inversions),“inv”通常用来表示核酸序列的倒置,具体如下:

(3)不同等位基因上的SNP,具体表示规则为:[等位基因1]+ [等位基因2],例如:

(4)等位基因上存在2个突变,具体表示规则为:[突变1]+ [突变2],例如:

参考文献

  1. http://www.biojgwt.com/index.php?m=content&c=index&a=show&catid=21&id=13
上一篇 下一篇

猜你喜欢

热点阅读