学习小组Day2笔记--孔嘉豪

2020-09-16 本文已影响0人孔嘉豪

_Day1 _{高效学习平台和方法推荐}
_Day2-3 Linux基础
_Day4-6 _{R语言基础}
_Day7 _测序知识

今日待解决问题：

什么是linux，什么是服务器？
为什么学生信要用linux？
怎样召唤linux--阿里云服务器
怎样登录服务器--xshell和terminal
linux有哪些最基本的操作？

1. 什么是linux，什么是服务器？

1.1. linux

linux类似windows、mac，是一种电脑操作系统，因其开源、免费、稳定、安全的特点而被熟知。通常一台电脑不能同使用双系统，但是可以通过使用模拟器的手段实现操作，即在我自己windows系统的电脑上通过下载并注册xshell、ubuntu等使用linux系统（mac系统可以在terminal中直接使用）。

linux 摘自知网知识问答

1.2. 服务器

玩过lol、dota2、dnf、cf、ro等等网游的朋友，就很容易理解什么是服务器。通常玩一款网游，作为用户首先需要有一台自己的电脑（自备），其次在这台电脑上下载客户端（Xshell），接着输入账号密码（豆花的邮件提供），等待服务器的连接（update），然后就是开耍了（实操练习）。
个人理解：服务器就是一台特别的中央计算机，比我们一般用的运行更快、性能更佳，能同时服务多个用户使用，避免自己烧钱买基本设备。

服务器摘自百度百科

2. 为什么学生信要用linux？

我认为明白这个问题的前提是知道 —— 何为生信？
生信的本质就是对于生物数据的处理。信息爆炸年代到来已久，许多东西已经是无法单凭人工完成，例如人类基因组共31.6亿个碱基对，每次测序都会产生大量的数据文件，若再以人力分析这些简单的对比任务，就会花费更大量的时间、精力、财力。因此需要一些程序、命令来执行这些操作，例如linux、python等。

_参考_{什么是生物信息学？--知乎}_、_{0成本召唤linux} _{--生信星球}

3. 怎样召唤linux--阿里云服务器

3.1. 下载Xshell

已通过花花今日份教程中的百度盘连接成功下载安装。

4. 怎样登录服务器--xshell

由于贴心的豆豆和花花已经帮我申请了一周的服务器，所以在Xshell中根据教程可直接登录~

ssh 账号@ip地址      #步骤1 输入后回车，例如bio01@120.50.110.110 

Connecting to 120.50.110.110:22 ...
Connection established.
To escape to local shell, press 'Ctrl+Alt+]'.     #步骤2 自动出现对话框，输入密码后确认

Welcome to Ubuntu 18.04.1 LTS (GNU/Linux 4.15.0-54-generic x86_64)

 * Documentation:  https://help.ubuntu.com
 * Management:     https://landscape.canonical.com
 * Support:        https://ubuntu.com/advantage

  System information as of Tue Sep 15 15:06:49 CST 2020

  System load:  0.23               Processes:           103
  Usage of /:   34.8% of 49.15GB   Users logged in:     2
  Memory usage: 31%                IP address for eth0: 110.10.0.10
  Swap usage:   0%

 * Kubernetes 1.19 is out! Get it in one command with:

     sudo snap install microk8s --channel=1.19 --classic

   https://microk8s.io/ has docs and details.

 * Canonical Livepatch is available for installation.
   - Reduce system reboots and improve kernel security. Activate at:
     https://ubuntu.com/livepatch

*** System restart required ***

The programs included with the Ubuntu system are free software;
the exact distribution terms for each program are described in the
individual files in /usr/share/doc/*/copyright.

Ubuntu comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY, to the extent permitted by
applicable law.

/usr/bin/xauth:  file /home/bio02/.Xauthority does not exist
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$          #步骤3 可以开始实践操作了

用户身份验证对话框

5. linux有哪些最基本的操作？

5.1 显示路径

pwd ：print working directory，即显示当前所在目录路径，如下

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ pwd
/home/bio01                             #当前位置为home的bio01目录内

5.2 创建目录

mkdir ：make directory，即创建一个目录，如下

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ mkdir biosoft     #回车后即创建成功
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ mkdir project
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ mkdir tmp
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ mkdir src

5.3 显示列表

ls ：list show，即显示当前所在目录的列表内容，如下

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ ls
biosoft  project  src  tmp test.txt       #当前目录内有4个子目录(蓝字)和1个文档(白字)

5.4 删除文档

rm ：remove，即删除当前所在目录的文档；
rmdir ：remove directory，即删除当前所在目录下的目录，如下

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ rm test.txt        #删除指定文档
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ pwd
biosoft  project  src  tmp                 #删除成功
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ rmdir src        #删除指定目录
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ pwd
biosoft  project  tmp                    #删除成功

5.5 转跳目录、返回

cd ：change directory，即转跳目录功能，若单一个cd则返回主目录，如下

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ cd tmp           #回车后即转跳成功
bio01@VM-0-10-ubuntu:/tmp~$ pwd          #查看自己位置，其实$前就是现在所在目录
/home/bio01/tmp
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ cd               #回车后即返回主目录
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ pwd              
/home/bio01
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ cd -             #回车后即返回
bio01@VM-0-10-ubuntu:/tmp~$ pwd
/home/bio01/tmp

5.6 创建文档

vi ：是linux自带的文本编辑器，可以创建一个文档文件（vim亦可），如下

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ vi test.txt     #回车后即创建成功，亦是打开文档

i have a pen            #需要先按一下i，或者按一下空格就可以编辑了
you have an apple
emm ah
apple-pen|              #此处光标所在，即输入该文档内容
~
~
~
~                       #按下Esc键后的左下角insert小时，输入 :x 结束指令
-- INSERT --                                                         4-10         All

5.7 内容输出

cat ：concatenate，即连接文件并打印到标准输出设备上；
head -n 数字 ：即查看文件开头部分，默认为10行；
tail -n 数字 ：即查看文件开头部分，默认为10行，如下

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ cat test.txt   #命令输出文档
i have a pen
you have an apple
emm ah
apple-pen                              #内容已输出

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ head -n 3 hello_world.txt   #仅输出文档前3行内容
i have a pen
you have an apple
emm ah                                              #内容已输出

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ tail -n 2 hello_world.txt   #仅输出文档最后2行内容
emm ah
apple-pen                                           #内容已输出

5.8 复制

cp ：copy file，即复制文档，如下

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ mv test.txt test2.txt      #将test.txt文档复制一份test2.txt
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ ls
biosoft  project  test2.txt  test.txt  tmp    #复制成功

5.9 移动文档和重命名文档

mv ：move file，即移动文档或重命名文档，如下

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ mv test.txt word.txt      #将test.txt文档重命名为word.txt
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ ls
biosoft  project  tmp  word.txt              #已成功重命名

bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ mv word.txt ~/ptm         #将word.txt文档移入ptm目录内
bio01@VM-0-10-ubuntu:~$ cd tmp
bio01@VM-0-10-ubuntu:~/tmp$ ls
word.txt                                          #已成功移入tmp目录内

linux基础命令--思维导图