flash软件合并双端reads
2018-10-25 本文已影响2人
苏牧传媒
网页:
http://ccb.jhu.edu/software/FLASH/

用处:
有时候测得双端但是后续分析只用单端的时候,可以merge上R2端
下载安装:
wget FLASH-1.2.11-Linux-x86_64.tar.gz
tar zxvf FLASH-1.2.11-Linux-x86_64.tar.gz
cd FLASH-1.2.11-Linux-x86_64
pwd
直接运行:../flash --help
try:
.../flash ChAR-seq1_R1.fq ChAR-seq1_R2.fq -z
-z 为压缩