5️⃣蛋白质的特征信息2:信号肽的预测和识别
2019-02-03 本文已影响86人
Y大宽
序列比对和序列特征分析总目录
- 信号肽signal peptide是新合成多肽链中的末端(通常N末端)的氨基酸序列,这个序列可以指导蛋白质的跨膜转移。
- 信号肽中包含至少一个带正电荷的氨基酸和一个高度疏水区以通过细胞膜
- 信号肽是新生肽链分泌到细胞外的信号也是一些蛋白质在细胞内的定位信号
- 因为分泌到胞外的蛋白质不含有信号肽,所以只能从细胞内分离不成熟的肽链,进行N末端测序,来了解信号肽的结构特征
- 目前发现,信号肽序列中含较多疏水性氨基酸较多是明显特征
信号肽预测在线工具:SignalP
目前4.1版,通过人工神经网络方法,预测包括革兰氏阳性菌,革兰氏阴性菌及真核生物在内的**氨基酸序列信号肽剪切位点的有无及出现位置。
HGFAC
1 输入蛋白质序列:FASTA格式
其他参数设置:待续。。。
2 结果
Result