基因芯片基础知识

探针组：来自于一个基因，通常由20对或者11对探针组成，每一探针对又分为匹配探针PM和错配探针MM

探针

DAT文件：荧光信号图像文件

CEL文件：只提供提供每个探针的灰度信息，是基因芯片分析的最原始数据。自cellheader开始，包含5列信息，依次为X坐标、Y坐标、灰度的平均值、灰度的标准差以及用了多少个像素来求这个平均值。

CDF文件：指定基因芯片探针排布的信息（即指定CEL文件中哪个探针来自于哪个探针组）

Probe文件：提供探针的序列信息

文件关系

eSet：是Bioconductor为基因表达数据格式所定制的标准