Cook R生信星球培训第七期

学习小组Day4笔记--蓝天

2018-10-11  本文已影响49人  蓝天_乎乎

知识诅咒
所以内行人要理解外行人的诸多提问,虽然这些问题看起来太简单。

R软件安装

感谢果子的教程

1.下载R和RStudio

R是核心,而RStudio使R的使用更容易
如同IE和chrome(但是这两个的核心好像有区别),IE和国产浏览器

2.改镜像

普通安装R包镜像和bioconductor R包镜像

#bioconductor
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
#CRAN
options(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")

#检查是否设定完毕
getOption("BioC_mirror")
getOption("CRAN")

3.修改放置R包的文件夹权限

.libpaths()

4.配置bioconductor安装环境

source('biocLite.R')
biocLite()

5.RStudio需要修改成管理员权限打开

6.安装R包和bioconductor的R包

BiocInstaller::biocLite(' geoquery  ')
install.packages(' tidyverse  ')
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