使用FuSeq_WES处理WES数据寻找fusion-gene
2023-05-16 本文已影响0人
面面的徐爷
数据比对
bwa mem -t 10 ~/genome/BWA_index/GRCh38 1.rawdata/xyz-R1.fastq.gz 1.rawdata/xyz-R2.fastq.gz | samtools sort -@ 10 -o xyz.bam -
samtools index xyz.bam
使用FuSeq_WES
bwa mem -t 10 ~/genome/BWA_index/GRCh38 1.rawdata/xyz-R1.fastq.gz 1.rawdata/xyz-R2.fastq.gz | samtools sort -@ 10 -o xyz.bam -
samtools index xyz.bam