Day3-蒙蒙帮主-linux环境下上手fastqc。。。
2019-11-28 本文已影响0人
蒙蒙帮主
写在前面:
用以自省
很久之前,有一堂有老师传道授业的课程摆在我的面前,我去没有好好珍惜,如果上天在给我一下机会,我会对蹭这堂课为了混饭局的自己说:吃什么饭,我要学!
这个感叹来自于在很久很久以前(没有王子🤴,更没有公主👸),被安利学习 pathon。。。对啊,pathon好,patron妙,学好patron呱呱叫。。。嗯,下载了这个我也不知道干啥的软件。。。然后,就没有然后了。。也就错过了一位优秀的老师开设的💗爱心课堂。。。当然,这也是在今晚看着冷冰冰的文案自己学的时候翻然悔悟的。朋友们,有用的东西能学还是尽早学哦,有人教的话更要抓准机会哦。
linux用来做啥子?
OK,言归正传,昨天对linux有了初步认识,接下来就要小试牛刀喽(我的理解就像买一部新手机📱,第一件事情,肯定是,下载App!!!淘宝,京东统统都安排)。。。哈哈,有了linux,当然也要下载做分析的“APP”啦。
认识Miniconda-软件管理器吧!
基于linux,Miniconda-软件管理器,就是一个不错👌的APP宝库选择。这个软件的优缺点分析等全方位的介绍,大家动动小指头👋都可以搜到啦。。。这里不做赘述,其实我也赘述不出来的。
Miniconda如何安装呢?
简单总结如下:
- 准备工作(下载+安装+配置)
- 搜索“miniconda 清华”,找到软件下载链接🔗;
- 打开虚拟服务器,找到一个目录(mkdir 目录名);
- 进入该目录(cd 目录名);
- wget ➕下载链接;
- 输入 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 命令行,继续安装!
-
同意 ➕接受
巴拉巴拉系统给你的各种友情提示。。。; - 安装成功;
- 激活source ~/.bashrc;
-
添加镜像。
摘自 生信信球 整理
- 上手使用(这里就先试试fastqc)
- 查看软件列表(conda list);
- 搜索我们想要初步尝似的的fastqc软件(conda search fastqc);
- 安装软件 (conda install fastqc -y);
-
卸载软件 (conda remove fastqc -y)。
以上这些就写在命令行,linux就乖乖执行啦。。。🤖️
安装。。。
卸载。。。
以上low low的大小不一的截图就当留个纪念吧。。。毕竟人生第一次。。。看到代码咕噜咕噜跑~
今日小结
其实我就是想试试。。这个粉色背景。。啊哈,收工!!!今天一开始有点头大,超级头大!
哈哈哈,不过依着葫芦画瓢,比着教程顺了几遍,有了一丢丢理解。。。
后面还有一个网友小伙伴的帮祝,帮我攻克了最后一个小难关。。。继续加油!要做有思想的烂泥巴。。。
书读百遍,其义自现。Go,Go,Go。(