利用CTAB法提取昆虫DNA的步骤及原理

2023-12-06  本文已影响0人  发现Lichens

利用CTAB提取褐飞虱DNA

    为了搞清楚实验操作的原理以及试剂的作用,整理了很多资料,对很多实验步骤的细节进行了补充,可能有误,内容仅供参考,欢迎指正。

CTAB提取DNA缓冲液配方:2%CTAB,1.4M NaCl,100mM Tris-HCl(pH 8.0),20 mMEDTA。具体配置步骤:

(1)1 M Tris-HCl(pH 8.0):在160 mL ddH2O中溶解24.2 g Tris,用浓HCl调节pH至pH 8.0,加ddH2O定容至200 mL;

(2)0.5 M EDTA(pH 8.0):在80 mL ddH2O中加入16.81 g Na2EDTA(二水乙二胺四乙酸二钠),搅拌溶解,用NaOH固体颗粒调pH至8.0,定容至100 mL;

(3)CTAB提取DNA缓冲液(200 mL):CTAB4 g,NaC116.364 g,1 M Tris-HCl 20 mL(pH 8.0),0.5 M EDTA 8 mL(pH 8.0),再用ddH2O定容至200 mL,高压灭菌备用。

提取褐飞虱基因组DNA(单头试剂用量减半),具体方法如下:

(1)根据需要配制适量的氯仿-异戊醇混合液(24:1),水浴锅65℃预热,取适量异丙醇于-20℃预冷;

(2)CTAB缓冲液65℃预热后加入0.5-1.0% β-巯基乙醇;

(3)向装有单头褐飞虱的2 mL研磨管中加入两粒灭菌的直径3 mm钢珠,再加入800 μL 65℃预热过的CTAB缓冲液(含β-巯基乙醇),用全自动样本研磨仪60 Hz研磨2次,每次1 min;

(4)放入65℃水浴锅水浴15 min,期间摇动1次使CTAB与样本充分混合;

(5)取出研磨管常温冷却2 min,加入800 μL氯仿-异戊醇混合液(24:1),缓慢摇晃1-2 min使溶液混匀;

(6)12,000 r/min离心5-10 min,小心吸取上清至新的1.5 mL离心管中,再次加入700 μL氯仿-异戊醇混合液,缓慢摇晃1-2 min;

(7)12,000 r/min离心5-10 min,小心吸取上清至新的1.5 mL离心管中;

(8)迅速中加入等体积的-20℃预冷过的异丙醇,混匀,-20℃放置2 h(单头需过夜);

(9)12,000 r/min离心5-10 min,弃去液体,留下离心管底部的DNA沉淀;

(10)加入1 mL 70%乙醇洗涤DNA沉淀,洗涤2次;

(11)吸去多余乙醇,将含有DNA沉淀的离心管开盖置于超净工作台风干;

(12)风干后用10-20 μL ddH2O溶解DNA沉淀,保存至-20℃待用。

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