转录组入门二（mac版）：读文献下数据
2017-10-17 本文已影响248人
Thinkando
转录组入门二，读文献下数据
- 在NCBI查文章：
AKAP95 regulates splicing through scaffolding RNAs and RNA processing factors. Nat Commun 2016 Nov 8;7:13347. PMID: 27824034
-
找数据地址
image.png
-
去GSE网站，搜GSE81916
image.png
image.png
- 下载代码
# 在终端运行
#用axel下载会快一些
brew install axel
for i in {56..62}
do
# 也可以用wget 下载
axel ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByStudy/sra/SRP/SRP075/SRP075747/SRR35899$i/SRR35899$i.sra
done
