学习R包

R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包，以学习dplyr包为例。

1. BiocManager的安装

• 设置镜像：参见你还在每次配置Rstudio的下载镜像吗？
• 下载rtool

options(download.file.method = 'libcurl')
options(url.method='libcurl')

• 下载并安装

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()

R版本与BiocManager的兼容性

2. 安装和加载R包

• R包安装命令install.packages(“包”)或者BiocManager::install(“包”)，这取决于包存在于CRAN网站还是Biocductor。
• 加载：library(包)或require(包)

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 
install.packages("dplyr")
library(dplyr)

3. dplyr

3.1 dplyr五个基础函数

dplyr五个基础函数

3.2 dplyr两个实用技能

• 管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
• count统计某列的unique值

3.3 dplyr处理关系数据

dplyr处理关系数据

结语

今天搞镜像设置时，发现没安装BiocManager；而安装BiocManager时，研究半天，也学到了许多。对于dplyr包的认知，还需继续努力。