数据下载两三事
2020-07-11 本文已影响0人
yilunanxia
最近在忙于搭建一个小的服务器用作生物信息分析。其中些许问题做一个简单的笔记。
1 数据库放在了Dropbox。外国人真的很喜欢用Dropbox的样子。记得两年前一个大佬把PPT放在了Dropbox,让我下载然后用作演讲。可谁料PPT的大小100多M,科学上网好艰辛。平时也就用用ghelper和谷歌访问助手,但是科学上网真的懒得弄,用处也不大。这次遇到的是metaphlan的数据库在Dropbox,然后拜托了别人从香港的服务器下载然后传回国内。o(╯□╰)o突然间有种冲动是好像有一个香港的服务器。
2 SRA数据下载。网上搜索下载NCBI的SRA数据,大多介绍里都有sratoolkit和wget等方法,然而速度真的好慢。如果下载量很小的话直接忽略后文吧。然后发现了一个好用的工具。详见https://github.com/wangshun1121/ASCPsra。感觉差不多就像mac上有会员的百度网盘和没有会员的百度网盘。