BioCyc数据库简介

一、介绍

1.BioCyc

BioCyc是代谢途径的数据库集合，集合中的每个数据库描述了单个生物体的基因组和代谢途径（MetaCyc是来自代谢途径的参考来源），包括反应、酶、基因和底物化合物。第一层数据库包含EcoCyc、MetaCyc和BOCD，第二层和第三层数据库则包含了计算预测代谢通路，以及哪些基因编码代谢通路中缺少酶的预测和预测的操纵子。BioCyc提供的分析工具包括：基因组浏览器、个体代谢通路和完整代谢图的显示等。
【https://humancyc.org/publications.shtml#】
【http://metacyc.ai.sri.com/PToolsWebsiteHowto.shtml#SearchHelp】

2.MetaCyc

MetaCyc数据来源科学实验文献，为代谢通路和酶提供了大量的参考信息，含有初生代谢和次生代谢通路，还包括相关的化合物、酶和基因。Metacyc是一个多有机体数据库，其他生物数据库描述单个生物体的代谢网络和基因组，并将实验确定的路径与计算预测的路径混合。Metacyc仅包含实验阐明的途径。
MetaCyc的应用：查询代谢通路、预测基因组测序中的代谢通路、通过酶数据库支持代谢通路。

二、使用

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参考：
1.国基还未中？你与国基之间可能就差这么几个数据库！！