Day 2 —刘强

What's Linux？

Linux 是一种操作系统（Operating System，OS）。
区别于windows的图形界面，Linux的操作需要命令行执行。
可实现多用户同时使用，互不干扰，常用于服务器（supercomputer）。
无分盘，执行目录结构。

Why we need Linux？

Linux 是开源，免费，无图形界面，可最大限度调用计算机性能用于计算。
命令行模式可支持批量文件操作，满足海量数据处理需求。

How we can conduct Linux?

• win10 内置Linux，去windows APP store下载安装
• 安装Linux系统（不推荐）
• win7安装虚拟机，git bash
• Mac 自带terminal
• 本地服务器
• 云服务器 (putty)

Linux 命令

Linux命令（Ref：生信星球）.png

练习作业

• ls输出的是横向的列表，怎样输出长格式列表
  ls -l 可输出长格式列表
• 如何查看长格式列表中文件的大小？
  ls -lk 可查看长格式列表中文件的大小
• 查看Linux系统版本、内存与硬盘空间？
  查看Linux系统版本
  lsb_release -a，即可列出所有版本信息
  cat /etc/redhat-release，这种方法只适合Redhat系的Linux
  cat /etc/issue，此命令也适用于所有的Linux发行版。
  查看Linux系统内存

1.top (Ref:https://blog.csdn.net/u014311799/article/details/78775175 )
PID：当前运行进程的ID
USER：进程属主
PR：每个进程的优先级别
NInice：反应一个进程“优先级”状态的值，其取值范围是-20至19，一
　　　　共40个级别。这个值越小，表示进程”优先级”越高，而值越
　　　　大“优先级”越低。一般会把nice值叫做静态优先级
VIRT：进程占用的虚拟内存
RES：进程占用的物理内存
SHR：进程使用的共享内存
S：进程的状态。S表示休眠，R表示正在运行，Z表示僵死状态，N表示
　 该进程优先值为负数
%CPU：进程占用CPU的使用率
%MEM：进程使用的物理内存和总内存的百分比
TIME+：该进程启动后占用的总的CPU时间，即占用CPU使用时间的累加值。
COMMAND：进程启动命令名称
２.free
total : 总计物理内存的大小。
used : 已使用多大。
free : 可用有多少。
Shared : 多个进程共享的内存总额。
Buffers/cached : 磁盘缓存的大小。
-/+ buffers/cached) :
used:已使用多大;
free:可用有多少。
注意：
（mem）的used/free与(-/+ buffers/cache) used/free的区别：
这两者的区别在于使用的角度来看，前者是从OS（Operating Sys）的角度来看，因为对于OS，buffers/cached 都是属于被使用，所以他的可用内存是11737644KB,已用内存是54215352KB,
后者所指的是从应用程序角度来看，对于应用程序来说，buffers/cached 是等于可用的，因为buffer/cached是为了提高文件读取的性能，当应用程序需在用到内存的时候，buffer/cached会很快地被回收。
所以从应用程序的角度来说，可用内存=系统free memory+buffers+cached。
3.cat /proc/meminfo
查看RAM使用情况最简单的方法是通过命令：cat /proc/meminfo；
这个动态更新的虚拟文件实际上是许多其他内存相关工具(如：free / ps / top)等的组合显示。
/proc/meminfo列出了所有你想了解的内存的使用情况。
进程的内存使用信息也可以通过命令：cat /proc//statm 、 cat /proc//status 来查看。
4.ps aux –sort -rss
ps aux: 列出目前所有的正在内存当中的程序。
a显示终端上地所有进程,包括其他用户地进程(有的进程没有终端)。
-a 显示所有终端机下执行的进程，除了阶段作业领导者之外。
u 　以用户为主的格式来显示进程状况。
x 　显示所有进程，不以终端机来区分。
a会包括其他用户(否则只有用户本身); x会包括其他终端;
aux就可以包括内存所有;
USER：该 process 属于那个使用者账号的
PID ：该 process 的号码
%CPU：该 process 使用掉的 CPU 资源百分比
%MEM：该 process 所占用的物理内存百分比
VSZ ：该 process 使用掉的虚拟内存量 (Kbytes)
RSS ：该 process 占用的固定的内存量 (Kbytes)
TTY ：该 process 是在那个终端机上面运作，若与终端机无关，则显示 ?，另外， tty1-tty6 是本机上面的登入者程序，若为 pts/0 等等的，则表示为由网络连接进主机的程序。
STAT：该程序目前的状态，主要的状态有
R ：该程序目前正在运作，或者是可被运作
S ：该程序目前正在睡眠当中 (可说是 idle 状态)，但可被某些讯号 (signal) 唤醒。
T ：该程序目前正在侦测或者是停止了
Z ：该程序应该已经终止，但是其父程序却无法正常的终止他，造成 zombie (疆尸) 程序的状态
START：该 process 被触发启动的时间
TIME ：该 process 实际使用 CPU 运作的时间
COMMAND：该程序的实际指令
5.vmstat -s
vmstat命令显示实时的和平均的统计，覆盖CPU、内存、I/O等内容。例如内存情况，不仅显示物理内存，也统计虚拟内存。
6.gnome-shell-system-monitor-applet
Gnome-shell系统监视器gnome-shell-system-monitor-applet,是一个Gnome-shell 面板小程序，此程序用户监视CPU占用百分比、内存使用和SWAP使用情况，如图通过顶部栏显示和关闭。

• 怎样建立类似/tmp/tmp1/tmp1.1 这样的层级目录?

1. mkcd tmp/tmp1/tmp1.1
2. mkdir -p tmp/tmp1/tmp1.1

• 怎样删除这些层级目录?
  rm -rf tmp/tmp1/tmp1.1