工具 | fa/fq 文件操作

2022-07-26  本文已影响0人  shwzhao

想对 fasta 或者 fastq 文件进行操作,首先就应该想到的软件。
我一般用 seqkit,碰到具体问题时会去参考 [1] 中现查。

具体请参考:
[1] https://bioinf.shenwei.me/seqkit/usage/
[2] https://github.com/lh3/seqtk/
[3] 公众号 | mBioinfo | SeqKit -- FASTA/Q序列处理神器(作者本人写的)
[4] 公众号 | 生信宝典 | seqkit:序列梳理神器-统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等30项全能

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