aspera 使用（简版）

系统：ubuntu 18.0

环境：miniconda3

软件安装：conda install -c hcc aspera-cli

下载数据：

通过SSH连接：

ascp -v -k 1 -T -l 200m -i ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh anonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR857/SRR8571514/SRR8571514.sra ./

主机：

ascp -v -k 1 -T -l 200m -i ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.putty anonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR857/SRR8571514/SRR8571514.sra ./

批量下载：

for((i=488;i<=511;i++));do wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR857/SRR8571$i/SRR8571$i.sra；done

详见：https://www.jianshu.com/p/fdbd4c13fa29

           https://blog.csdn.net/herokoking/article/details/78890567

           https://blog.csdn.net/qq_29300341/article/details/72595390

报错及解决方法：

ascp: Target address not available   #检查asperaweb_id_dsa.openssh 自己安装后的openssh位置和测序数据存放地址是否有误。

ascp: Failed to open TCP connection for SSH, exiting.  #可能是网络、防火墙问题，未解决