TCGA-GDC

1、打开网站 ：https://portal.gdc.cancer.gov/

点击Reprository

2、从Cases这里选择TCGA和Project里面勾选疾病

Cases

3、从Files选择数据类型：这里我们选择counts

基因的数据

如果是要分析miRNA的数据，Data Type和Experimental Strategy就要选择miRNA

最终选择结果

4、点击下载清单Manifest

下载中
下载结果

5、点击购物车把json文件下载下来

点击全部加入购物车
点击Metadata下载
json文件

6、清空Files里面勾选的内容，再重新选择Files里面的Clinical

再次点击Manifest下载Clinical的数据
选择结果 最终下载得到的3个文件

有了上面几个文件，就可以进行数据的分析了。