cytoscape隐藏一部分边

用cytoscape画ppi的时候总是网络过大，边太多，做出来的图就乱七八糟、黑乎乎的，像下面这样：

ppi网络

解决办法就是隐藏一部分边就可以美观很多啦。

首先，得做一个边文件，选出你想要保存的重要的边。我是用R做的，边的格式像下面这样：

边文件

第一列是genea (interacts with) geneb，注意有空格，第二列是边的分组。把想要的边放入一组。

导入table，选导入边，之后就变成这样了

导入table 边的属性多了一组

然后！重点来了，把不需要的边透明度调成0，需要的边调成255（或者随意）：

列选择你定义的组

边一下子就少了不少啦

看起来好多了

最后改一改边、点颜色大小粗细形状巴拉巴拉，一个图就看来干净不少啦

就杰样吧